Cronogramas

	Semanas
Tarefas	Ago-Set	Set	Set	Set	Set	Out	Out	mês de Nov	mês de Dez
	29-02	05-09	12-16	19-23	26-30	03-07	10-14
1o Modelo Dengue-TerraME
Estudo TerraME
Implementação Modelo
Modelagem baseada em agentes
Estudo de material teórico
Estudo ABM-TerraME
Modelos Hierárquicos
Compreensão Geral (exemplos)
Estudo teórico
Aplicações em dengue (exemplos)
Outras atividades
Artigo GeoInfo
Cooperação/Sandra Sandri
Lauren Smith - Preparativos/Visita
Leitura/revisão artigos worcap
Plano/PRONEX

• Legenda:
  • Tentando entender
  • Em andamento e/ou estudando e entendendo
  • Tarefa em execução/não concluída
  • Tarefa concluída
  • Código pronto, esperando para rodar
  • Código rodando
  • Fiz uma gambiarra em Lua, tem que ser acertado em C++ posteriormente

• Organização Workshop PRONEX Modelagem em Dengue
• Southern-Summer School on Mathematical Biology, São Paulo
• Estudo de material do Summer School
• Colaboração com Sandra Sandri e seu aluno de mestrado (Walley): fuzzy em TerraME, aplicações em epidemiologia
• Estudo de populações e metapopulações (Ricklefs, 2003)

• Organização Workshop PRONEX Modelagem em Dengue
• Colaboração com Sandra Sandri e seu aluno de mestrado (Walley): fuzzy em TerraME, aplicações em epidemiologia
• Estudo para Modelo-Dengue (Direções Gerais):
  • Metapopulações
    1. Teoria de populações e metapopulações (Ricklefs, 2003; Hanski, 1998)
    2. Modelagem clássica de metapopulações, via equações diferenciais e principais resultados (Hanski, 1991; Hanski, 1994; Marquet, 2002)
    3. Individual Based Models and metapopulations (Keeling, 2002; Graniero, 2007)
    4. Modelos de metapopulações para doenças (Arino, ano?; Watts et al., 2005)
    5. Redes complexas e metapopulações (Colizza & Vespignani, 2008; Balcan et al., 2009; Ajelli et al., 2010; Vespignani, 2008)
  • Modelagem hierárquica (Sloot & Hoekstra, 2010)
• Estudos específicos para Modelo-Dengue
  • Dispersão de mosquitos (Honório, 2003)
• Colaboração com César Castilho: estudo e simulações de virulência
• Colaboração com Wayner e Cynthia

Referências

• Ricklefs RE (2003). A Economia da Natureza. 5ª Edição. Editora Guanabara Koogan S. A., Rio de Janeiro. 503p.
  

• Hanski I (1998). Metapopulation dynamics
  

• Hanski I (1991). Single-species metapopulatin dynamics: concepts, models and observations
  

• Hanski I (1994). A practical model of metapopulation dynamics
  

• Marquet PA (2002). Metapopulations
  

• Keeling MJ (2002). Using individual-based simulations to test the Levins metapopulation paradigm
  

• Graniero PA (2007). The influence of landscape heterogeneity and local habitat effects on the response to competitive pressures in metapopulations
  

• Arino J. Diseases in metapopulations
  

• Watts DJ, Muhamad R, Medina DC, Dodds PS (2005). Multiscale, resurgent epidemics in a hierarchical metapopulation model
  

• Colizza V & Vespignani A (2008). Epidemic modeling in metapopulation systems with heterogeneous coupling pattern: Theory and simulations.
  

• Balcan D, Colizza V, Gonçalves B, Hu H, Ramasco JJ, Vespignani A (2009). Multiscale mobility networks and the spatial spreading of infectious diseases.
  

• Ajelli M, Gonçalves B, Balcan D, Colizza V, Hu H et al. (2010). Comparing large-scale computational approaches to epidemic modeling: Agent-based versus structured metapopulation models.
  

• Vespignani A (2008). Reaction-diffusion processes and epidemic metapopulation models in complex networks. Eur. Phys. J. B, 64: 349–353. DOI: 10.1140/epjb/e2008-00302-y.
  

• Sloot PMA & Hoekstra AG (2010). Multi-scale modelling in computational biomedicine. Briefings in Bioinformatics, 11 (1): 142-152. doi:10.1093/bib/bbp038.
  

• Honório NA, Silva WC, Leite PJ, Gonçalves JM, Lounibos LP, Lourenço-de-Oliveira R (2003). Dispersal of Aedes aegypti and Aedes albopictus (Diptera: Culicidae) in na urban endemic dengue área in the state of Rio de Janeiro, Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, 98(2): 191-198.