======Cronogramas====== \\ ===== 2011 ===== | ^ Semanas ^^^^^^ ^ Tarefas ^ Ago-Set ^ Set ^ Set ^ Set ^ Set ^ Out ^ Out ^ mês de Nov ^ mês de Dez ^ ^ ^ 29-02 ^ 05-09 ^ 12-16 ^ 19-23 ^ 26-30 ^ 03-07 ^ 10-14 ^ ^ ^ ^ 1o Modelo Dengue-TerraME ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ | Estudo TerraME | 8-O | | | | | ;-) | ;-) | ;-) | | | Implementação Modelo | 8-O | | | | | 8-O | 8-O | 8-) :!: | 8-) :!: | ^ Modelagem baseada em agentes ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ | Estudo de material teórico | 8-O | 8-O | | | | | | | | | Estudo ABM-TerraME | | :-/ | | | | :-/ | | ;-) | ;-) | ^ Modelos Hierárquicos ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ | Compreensão Geral (exemplos) | :-/ | :-/ | | ;-) | | | | | | | Estudo teórico | | | :-/ | :-/ | ;-) | | | ;-) | | | Aplicações em dengue (exemplos) | | | | | | | | | | ^ Outras atividades ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ | Artigo GeoInfo | | | | | | | | 8-) | | | Cooperação/Sandra Sandri | ;-) | | | ;-) | ;-) | ;-) | ;-) | ;-) | ;-) | | Lauren Smith - Preparativos/Visita | :-/ | 8-O | 8-O | 8-) | | | | | | | Leitura/revisão artigos worcap | | ;-) | 8-O | 8-) | | | | | | | Plano/PRONEX | | | 8-) | | | | | | | \\ * Legenda: * :-/ Tentando entender * ;-) Em andamento e/ou estudando e entendendo * 8-O Tarefa em execução/não concluída * 8-) Tarefa concluída * :?: Código pronto, esperando para rodar * :!: Código rodando * FIXME Fiz uma gambiarra em Lua, tem que ser acertado em C++ posteriormente \\ ===== 2012 ===== ==== Janeiro/Fevereiro ==== * Organização Workshop PRONEX Modelagem em Dengue * Southern-Summer School on Mathematical Biology, São Paulo * Estudo de material do Summer School * Colaboração com Sandra Sandri e seu aluno de mestrado (Walley): fuzzy em TerraME, aplicações em epidemiologia * Estudo de populações e metapopulações (Ricklefs, 2003) ==== Previsão para Março, Abril, Maio e Junho ==== * Organização Workshop PRONEX Modelagem em Dengue * Colaboração com Sandra Sandri e seu aluno de mestrado (Walley): fuzzy em TerraME, aplicações em epidemiologia * Estudo para Modelo-Dengue (Direções Gerais): * Metapopulações - Teoria de populações e metapopulações (Ricklefs, 2003; Hanski, 1998) - Modelagem clássica de metapopulações, via equações diferenciais e principais resultados (Hanski, 1991; Hanski, 1994; Marquet, 2002) - Individual Based Models and metapopulations (Keeling, 2002; **Graniero, 2007**) - Modelos de metapopulações para doenças (Arino, ano?; **Watts et al., 2005**) - Redes complexas e metapopulações (**Colizza & Vespignani, 2008**; **Balcan et al., 2009**; **Ajelli et al., 2010**; Vespignani, 2008) * Modelagem hierárquica (Sloot & Hoekstra, 2010) * Estudos específicos para Modelo-Dengue * Dispersão de mosquitos (Honório, 2003) * Colaboração com César Castilho: estudo e simulações de virulência * Colaboração com Wayner e Cynthia \\ **Referências** \\ * Ricklefs RE (2003). A Economia da Natureza. 5ª Edição. Editora Guanabara Koogan S. A., Rio de Janeiro. 503p. \\ * Hanski I (1998). {{:wiki:private:1998.hanski.metapop_dyn_-_review.pdf|Metapopulation dynamics}} \\ * Hanski I (1991). {{:wiki:private:1991.hanski.metapop_dyn_-_concep-models-observ.pdf|Single-species metapopulatin dynamics: concepts, models and observations}} \\ * Hanski I (1994). {{:wiki:private:1994.hanski.practic_model_of_metapop_dyn.pdf|A practical model of metapopulation dynamics}} \\ * Marquet PA (2002). {{:wiki:private:2002.marquet.metapopulations.pdf|Metapopulations}} \\ * Keeling MJ (2002). {{:wiki:private:2002.keeling.using_ibm_to_test_levins_metapop_paradigm.pdf|Using individual-based simulations to test the Levins metapopulation paradigm}} \\ * Graniero PA (2007). {{:wiki:private:2007.automatos_cel_-_metapopulacao_-_multiescalas.pdf|The influence of landscape heterogeneity and local habitat effects on the response to competitive pressures in metapopulations}} \\ * Arino J. {{:wiki:private:arino.diseases_in_metapopulations.pdf|Diseases in metapopulations}} \\ * Watts DJ, Muhamad R, Medina DC, Dodds PS (2005). {{:wiki:private:2005.pnas.multiscale-resurgent_epi_in_hierarc_metapop_model.pdf|Multiscale, resurgent epidemics in a hierarchical metapopulation model}} \\ * Colizza V & Vespignani A (2008). {{:wiki:private:2008.colizza.jtb-metapop.pdf|Epidemic modeling in metapopulation systems with heterogeneous coupling pattern: Theory and simulations.}} \\ * Balcan D, Colizza V, Gonçalves B, Hu H, Ramasco JJ, Vespignani A (2009). {{:wiki:private:2009.balcan.multiscale_mobility_nets_and_infec_dis.pdf|Multiscale mobility networks and the spatial spreading of infectious diseases.}} \\ * Ajelli M, Gonçalves B, Balcan D, Colizza V, Hu H et al. (2010). {{:wiki:private:2010.ajelli.abm_x_metapop.pdf|Comparing large-scale computational approaches to epidemic modeling: Agent-based versus structured metapopulation models.}} \\ * Vespignani A (2008). Reaction-diffusion processes and epidemic metapopulation models in complex networks. Eur. Phys. J. B, 64: 349–353. DOI: 10.1140/epjb/e2008-00302-y. \\ * Sloot PMA & Hoekstra AG (2010). Multi-scale modelling in computational biomedicine. Briefings in Bioinformatics, 11 (1): 142-152. doi:10.1093/bib/bbp038. \\ * Honório NA, Silva WC, Leite PJ, Gonçalves JM, Lounibos LP, Lourenço-de-Oliveira R (2003). Dispersal of //Aedes aegypti// and //Aedes albopictus// (Diptera: Culicidae) in na urban endemic dengue área in the state of Rio de Janeiro, Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, 98(2): 191-198. \\