Table of Contents
Cronogramas
2011
Semanas | |||||||||
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Tarefas | Ago-Set | Set | Set | Set | Set | Out | Out | mês de Nov | mês de Dez |
29-02 | 05-09 | 12-16 | 19-23 | 26-30 | 03-07 | 10-14 | |||
1o Modelo Dengue-TerraME | |||||||||
Estudo TerraME | |||||||||
Implementação Modelo | |||||||||
Modelagem baseada em agentes | |||||||||
Estudo de material teórico | |||||||||
Estudo ABM-TerraME | |||||||||
Modelos Hierárquicos | |||||||||
Compreensão Geral (exemplos) | |||||||||
Estudo teórico | |||||||||
Aplicações em dengue (exemplos) | |||||||||
Outras atividades | |||||||||
Artigo GeoInfo | |||||||||
Cooperação/Sandra Sandri | |||||||||
Lauren Smith - Preparativos/Visita | |||||||||
Leitura/revisão artigos worcap | |||||||||
Plano/PRONEX |
- Legenda:
- Tentando entender
- Em andamento e/ou estudando e entendendo
- Tarefa em execução/não concluída
- Tarefa concluída
- Código pronto, esperando para rodar
- Código rodando
- Fiz uma gambiarra em Lua, tem que ser acertado em C++ posteriormente
2012
Janeiro/Fevereiro
- Organização Workshop PRONEX Modelagem em Dengue
- Southern-Summer School on Mathematical Biology, São Paulo
- Estudo de material do Summer School
- Colaboração com Sandra Sandri e seu aluno de mestrado (Walley): fuzzy em TerraME, aplicações em epidemiologia
- Estudo de populações e metapopulações (Ricklefs, 2003)
Previsão para Março, Abril, Maio e Junho
- Organização Workshop PRONEX Modelagem em Dengue
- Colaboração com Sandra Sandri e seu aluno de mestrado (Walley): fuzzy em TerraME, aplicações em epidemiologia
- Estudo para Modelo-Dengue (Direções Gerais):
- Metapopulações
- Teoria de populações e metapopulações (Ricklefs, 2003; Hanski, 1998)
- Modelagem clássica de metapopulações, via equações diferenciais e principais resultados (Hanski, 1991; Hanski, 1994; Marquet, 2002)
- Individual Based Models and metapopulations (Keeling, 2002; Graniero, 2007)
- Modelos de metapopulações para doenças (Arino, ano?; Watts et al., 2005)
- Redes complexas e metapopulações (Colizza & Vespignani, 2008; Balcan et al., 2009; Ajelli et al., 2010; Vespignani, 2008)
- Modelagem hierárquica (Sloot & Hoekstra, 2010)
- Estudos específicos para Modelo-Dengue
- Dispersão de mosquitos (Honório, 2003)
- Colaboração com César Castilho: estudo e simulações de virulência
- Colaboração com Wayner e Cynthia
Referências
- Ricklefs RE (2003). A Economia da Natureza. 5ª Edição. Editora Guanabara Koogan S. A., Rio de Janeiro. 503p.
- Hanski I (1998). Metapopulation dynamics
- Hanski I (1994). A practical model of metapopulation dynamics
- Marquet PA (2002). Metapopulations
- Arino J. Diseases in metapopulations
- Watts DJ, Muhamad R, Medina DC, Dodds PS (2005). Multiscale, resurgent epidemics in a hierarchical metapopulation model
- Colizza V & Vespignani A (2008). Epidemic modeling in metapopulation systems with heterogeneous coupling pattern: Theory and simulations.
- Balcan D, Colizza V, Gonçalves B, Hu H, Ramasco JJ, Vespignani A (2009). Multiscale mobility networks and the spatial spreading of infectious diseases.
- Ajelli M, Gonçalves B, Balcan D, Colizza V, Hu H et al. (2010). Comparing large-scale computational approaches to epidemic modeling: Agent-based versus structured metapopulation models.
- Vespignani A (2008). Reaction-diffusion processes and epidemic metapopulation models in complex networks. Eur. Phys. J. B, 64: 349–353. DOI: 10.1140/epjb/e2008-00302-y.
- Sloot PMA & Hoekstra AG (2010). Multi-scale modelling in computational biomedicine. Briefings in Bioinformatics, 11 (1): 142-152. doi:10.1093/bib/bbp038.
- Honório NA, Silva WC, Leite PJ, Gonçalves JM, Lounibos LP, Lourenço-de-Oliveira R (2003). Dispersal of Aedes aegypti and Aedes albopictus (Diptera: Culicidae) in na urban endemic dengue área in the state of Rio de Janeiro, Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, 98(2): 191-198.