As águas interiores compreendem diversos sistemas aquáticos, incluindo rios, lagos, lagoas, reservatórios e outros, e os dados de satélite desempenham um papel crucial ao fornecer observações holísticas e dinâmicas desses ecossistemas complexos. No entanto, os sensores de satélite disponíveis com resolução espacial média, como o Sentinel-2 Multi-Spectral Instrument (MSI), são projetados principalmente para o monitoramento terrestre e carecem de bandas espectrais adequadas e qualidade radiométrica para aplicações em ambientes aquáticos. Este estudo desenvolveu um novo método de geração de bandas sintéticas, denominado Sentinel-2/3 Synthetic Aquatic Reflectance Bands (S2/3Aqua), para calcular oito bandas espectrais sintéticas de 10 metros por meio de análise de regressão multivariada entre pares de imagens do Sentinel-2 MSI e do Sentinel-3 OLCI. Foram aplicados e avaliados três modelos de regressão multivariada—Regressor Linear Multivariado (MLR), Regressor Quadrático Multivariado (MQR) e Regressor de Floresta Aleatória (RFR)—para replicar a consistência espectral do Sentinel-3 em imagens de 10 metros do Sentinel-2. Um modelo de cianobactérias foi desenvolvido com base em observações in situ (n = 54), e demonstramos, pela primeira vez, a aplicação do mapeamento de florações de algas nocivas em 10 metros de resolução sobre dois reservatórios urbanos tropicais eutróficos (Promissão e Billings, Brasil). Além disso, a generalização do S2/3Aqua foi avaliada por meio da comparação de suas assinaturas espectrais em diferentes tipos ópticos de água. De forma geral, a comparação entre o S2/3Aqua e as bandas do Sentinel-3 obteve um erro absoluto médio de 6% e uma diferença média próxima de zero. Descobrimos que o modelo MLR apresentou maior precisão em relação às observações in situ (com um viés de 28%) e foi mais adequado do que os outros modelos testados. O S2/3Aqua também teve um bom desempenho em todas as oito bandas espectrais, incluindo nas faixas de 620 e 681 nm, com uma diferença média inferior a 0,003 unidades de reflectância. O mapeamento das cianobactérias mostrou um alto nível de concordância entre o S2/3Aqua e o Sentinel-3 para baixas concentrações de Ficocianina (menos de 50 mg m⁻³), e o S2/3Aqua capturou com eficácia a variabilidade espacial de florações menores e mais estreitas.Por fim, o S2/3Aqua fornece bandas espectrais sintéticas confiáveis que podem ser utilizadas de forma eficaz em diversos estudos de sistemas aquáticos, incluindo o monitoramento de florações de algas potencialmente nocivas.